CLR可說是.NET最核心的部分。從字面上就可以知道，它是一個可以讓不同語言寫成的應用程式都能正常運作的執行環境，這又被稱做 cross-language interoperability （跨語言的互通性）。CLR是如何達到跨語言的互通呢？若一個語言的編譯器想要使開發出來的.NET應用程式能在CLR中執行，它必須遵守Common Language Specification（共通語言規範，CLS）的規則。也就是說，不管是誰要自己寫一個支援.NET的編譯器，都必須遵守這規則。這樣，我們產生出來的應用程式就可以跟所有其他的.NET應用程式一起執行、交互使用。
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